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Enregistrement W1844975765 · doi:10.1111/j.1365-2559.2010.03554.x

Genomic and immunophenotypical differences between hepatocellular carcinoma with and without cirrhosis

2010· article· en· W1844975765 sur OpenAlexaff
Maria Tretiakova, Meer Taher Shabani-Rad, Kelly Guggisberg, John Hart, Robert A. Anders, Zu‐Hua Gao

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatocellular Carcinoma Treatment and Prognosis
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatocellular carcinomaCyclin D1CirrhosisCancer researchPathogenesisImmunohistochemistryBiologyWnt signaling pathwayPathologyCarcinomaTissue microarrayRetinoblastomaCell cycleMedicineCancerGeneInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To compare the expression of genes involved in p53, Wnt/beta-catenin, and retinoblastoma (Rb) 1 pathways between cirrhosis-associated hepatocellular carcinoma (HCC-C) and hepatocellular carcinoma arising in non-cirrhotic liver (HCC-NC). METHODS AND RESULTS: The gene expression profile was analysed using oligo-DNA arrays, and then validated at protein level in a tissue microarray using immunohistochemistry. Compared with their background non-neoplastic liver tissue, HCC-C showed a significantly higher rate of p53, beta-catenin (protein only) and cyclin D1 expression, whereas HCC-NC showed a significantly higher rate of p21(Waf1/cip1) and p27(Kip1) expression. HCC-C had a significantly higher rate of p53 expression and a significantly lower rate of p21(waf1/cip1) expression than HCC-NC. There was no statistically significant association between the expression of genetic markers and tumour histological grade, underlying aetiology, or lymphovascular invasion. Aberrant beta-catenin expression was more commonly seen in single tumours in comparison with multiple tumours. Increased p16(INK4) and p21(waf1/cip1) expression was more commonly observed in large-sized tumours (>50 mm) than small-sized tumours. CONCLUSIONS: Alteration of the p53 pathway plays a more important role in the pathogenesis of HCC-C, whereas alterations in cell cycle regulators p21(waf1/cip1) and p27(Kip1) play a more important role in the pathogenesis of HCC-NC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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