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Enregistrement W1848678194 · doi:10.1046/j.1537-2995.2003.00474.x

Extended blood grouping of blood donors with automatable PCR‐ELISA genotyping

2003· article· en· W1848678194 sur OpenAlexaff
Maryse St‐Louis, Josée Perreault, Réal Lemieux

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensUniversité LavalHéma-QuébecCegep de Sainte Foy
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypingAmpliconMultiplexConcordanceTypingGenotypeSerologyBiologyAntigenMultiplex polymerase chain reactionSubtypingMolecular biologyPolymerase chain reactionVirologyGeneGeneticsAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In the past 10 years, PCR-based methods have been described to allow the detection of gene polymorphisms responsible for many blood group antigens. These methods are routinely used to test samples of fetal origin and to resolve serologic discrepancies. Another interesting application of blood group genotyping could be the extended typing of blood donors for minor antigens to facilitate the procurement of compatible blood for alloimmunized patients. STUDY DESIGN AND METHODS: PCR-based tests have been modified to allow multiplex amplification of specific fragments of blood group genes and the convenient detection of hybridized amplicons by ELISA in a microplate format. RESULTS: The results obtained show that fragments of the Rh (D, c, C, e, E), Kell (K, k), Duffy (Fya, Fyb), and Kidd (Jka, Jkb) genes could be amplified along with controls in multiplex PCR reactions. Labeling of amplicons with digoxigenin allowed their solid-phase detection in microplate wells previously coated with individual blood group-specific oligonucleotides. A comparative study performed with 100 individuals showed a 99.7 percent concordance between genotypes and phenotypes for the 11 antigens assayed, with only three discrepant Fyb genotypes. CONCLUSION: Extended genotyping could be performed once on regular donors and confirmed when needed by standard serologic RBC assays. The format of these tests will allow easy automation of the procedure including the interpretation and downloading of the results with existing ELISA software.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,908

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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