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Enregistrement W1848728100 · doi:10.1111/j.1365-2605.2010.01085.x

New candidate targets of protein phosphatase-1c-gamma-2 in mouse testis revealed by a differential phosphoproteome analysis

2010· article· en· W1848728100 sur OpenAlex
Hannah Henderson, Graham MacLeod, Christopher Hrabchak, Susannah Varmuza

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Andrology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphataseBiologyDephosphorylationPhosphorylationSpermatogenesisGene isoformProteomicsMutantCell biologySerineMolecular biologyGeneGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reversible phosphorylation has been implicated in many developmental processes. Dephosphorylation is mediated by several families of phosphatases, including type 1 serine/threonine phosphatases (protein phosphatase-1 or PP1). The loss of the murine Ppp1cc gene causes male infertility as a result of impaired spermatogenesis. Ppp1cc encodes two splice isoforms, PPP1CC1 and PPP1CC2, with the latter being the most abundant isoform in the testis. However, the details of PPP1CC2's involvement in spermatogenesis are still unknown. As a phosphatase has been removed from the mutant mouse, a search for hyperphosphorylated proteins in the mutant testis may reveal the direct downstream targets of PPP1CC2. Using a whole tissue proteomics approach to identify testis-specific dephosphorylation targets of PPP1CC2, we found that two-dimensional electrophoresis identified 10 potential targets in the Ppp1cc null testis several of which are factors known to be important for spermatogenesis, such as HSPA2. Another potential target, tubulin, was found to be misregulated during Ppp1cc(-/-) spermatogenesis, disrupting manchette development. This work represents the first survey of the testicular phosphoproteome under pathological conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle