MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1856053518 · doi:10.1038/emboj.2011.79

STIM1 couples to ORAI1 via an intramolecular transition into an extended conformation

2011· article· en· W1856053518 sur OpenAlexafffund
Martin Muik, Marc Fahrner, Rainer Schindl, Peter B. Stathopulos, Irene Frischauf, Isabella Derler, Peter Plenk, Barbara Lackner, Klaus Groschner, Mitsuhiko Ikura, Christoph Romanin

Notice bibliographique

RevueThe EMBO Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAustrian Science FundÖsterreichischen Akademie der WissenschaftenHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésBiologyTransition (genetics)Intramolecular forceORAI1BiophysicsSTIM1Evolutionary biologyComputational biologyCell biologyGeneticsStereochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stromal interaction molecule (STIM1) and ORAI1 are key components of the Ca(2+) release-activated Ca(2+) (CRAC) current having an important role in T-cell activation and mast cell degranulation. CRAC channel activation occurs via physical interaction of ORAI1 with STIM1 when endoplasmic reticulum Ca(2+) stores are depleted. Here we show, utilizing a novel STIM1-derived Förster resonance energy transfer sensor, that the ORAI1 activating small fragment (OASF) undergoes a C-terminal, intramolecular transition into an extended conformation when activating ORAI1. The C-terminal rearrangement of STIM1 does not require a functional CRAC channel, suggesting interaction with ORAI1 as sufficient for this conformational switch. Extended conformations were also engineered by mutations within the first and third coiled-coil domains in the cytosolic portion of STIM1 revealing the involvement of hydrophobic residues in the intramolecular transition. Corresponding full-length STIM1 mutants exhibited enhanced interaction with ORAI1 inducing constitutive CRAC currents, even in the absence of store depletion. We suggest that these mutant STIM1 proteins imitate a physiological activated state, which mimics the intramolecular transition that occurs in native STIM1 upon store depletion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations234
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueThe EMBO JournalMême sujetIon Channels and ReceptorsTravaux en français237 207