Enrichment and characterization of MTBE-degrading cultures under iron and sulfate reducing conditions
Notice bibliographique
Résumé
The aim of this study was to enrich cultures capable of anaerobic methyl tert-butyl ether (MTBE) biodegradation and to determine their compositions using biomolecular tools. MTBE biodegradation as the sole carbon source was observed under Fe(III) and SO42–reducing conditions and with both electron acceptors present together. The estimated MTBE biodegradation rates ranged from 3.80 to 9.20 mg·L–1·d–1when Fe(III) was the sole electron acceptor, from 1.46 to 1.70 mg·L–1·d–1when Fe(III) and SO42–were present together, and from 1.13 to 1.71 mg·L–1·d–1when SO42–was the sole electron acceptor. Five to eight members were identified in the three consortia, and their characteristics were congruent with the electron acceptor conditions. A clone 99% similar to a recently described MTBE degrader, Ochrobactrum cytisi, was detected in both cultures containing Fe(III). Other 16S rRNA gene sequences detected were highly similar at the species or genus level to additional known MTBE degraders, including Pseudomonas spp. (cometabolic), Sphinogomonas, Achromobacter, and Rhodococcus. Results suggest that the buildup of intermediates and (or) the presence of sulfides had an inhibitory effect on biodegradation. Anaerobic MTBE biodegradation remains poorly understood, and degrading strains still have not been identified to date. This work represents the first detailed 16S rRNA gene profiling of highly enriched iron- and sulfate-reducing MTBE-degrading consortia. These results may provide useful biomarkers to support current efforts for confirming anaerobic MTBE biodegradation in the field.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».