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Enregistrement W1874571310 · doi:10.1139/l09-174

Enrichment and characterization of MTBE-degrading cultures under iron and sulfate reducing conditions

2010· article· en· W1874571310 sur OpenAlexfundvenueno aff
M. Raynal, Barbara Crimi, Amy Pruden

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Civil Engineering · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSuncor Energy Incorporated
Mots-clésBiodegradationElectron acceptorChemistryEnvironmental chemistryEnrichment culture16S ribosomal RNASulfate-reducing bacteriaSulfateOrganic chemistryBacteriaBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this study was to enrich cultures capable of anaerobic methyl tert-butyl ether (MTBE) biodegradation and to determine their compositions using biomolecular tools. MTBE biodegradation as the sole carbon source was observed under Fe(III) and SO42–reducing conditions and with both electron acceptors present together. The estimated MTBE biodegradation rates ranged from 3.80 to 9.20 mg·L–1·d–1when Fe(III) was the sole electron acceptor, from 1.46 to 1.70 mg·L–1·d–1when Fe(III) and SO42–were present together, and from 1.13 to 1.71 mg·L–1·d–1when SO42–was the sole electron acceptor. Five to eight members were identified in the three consortia, and their characteristics were congruent with the electron acceptor conditions. A clone 99% similar to a recently described MTBE degrader, Ochrobactrum cytisi, was detected in both cultures containing Fe(III). Other 16S rRNA gene sequences detected were highly similar at the species or genus level to additional known MTBE degraders, including Pseudomonas spp. (cometabolic), Sphinogomonas, Achromobacter, and Rhodococcus. Results suggest that the buildup of intermediates and (or) the presence of sulfides had an inhibitory effect on biodegradation. Anaerobic MTBE biodegradation remains poorly understood, and degrading strains still have not been identified to date. This work represents the first detailed 16S rRNA gene profiling of highly enriched iron- and sulfate-reducing MTBE-degrading consortia. These results may provide useful biomarkers to support current efforts for confirming anaerobic MTBE biodegradation in the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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