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Enregistrement W1879098942 · doi:10.1002/jat.2949

New developments in the evolution and application of the WHO/IPCS framework on mode of action/species concordance analysis

2013· review· en· W1879098942 sur OpenAlexaff
M.E. Meek, Alan R. Boobis, Ila Cote, Vicki L. Dellarco, G. Fotakis, Sharon Munn, Jennifer Seed, Carolyn Vickers

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Toxicology · 2013
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental Toxicology and Ecotoxicology
Établissements canadiensCentre for Advancing Health Outcomes
Organismes subventionnairesWorld Health Organization
Mots-clésConcordanceScope (computer science)Action (physics)Construct (python library)Chemical safetyRelevance (law)Risk assessmentRisk analysis (engineering)Mode of actionComputer scienceAdverse Outcome PathwayIn silicoData scienceManagement scienceComputational biologyMedicineBiologyBioinformaticsToxicologyEngineeringPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The World Health Organization/International Programme on Chemical Safety mode of action/human relevance framework has been updated to reflect the experience acquired in its application and extend its utility to emerging areas in toxicity testing and non-testing methods. The underlying principles have not changed, but the framework's scope has been extended to enable integration of information at different levels of biological organization and reflect evolving experience in a much broader range of potential applications. Mode of action/species concordance analysis can also inform hypothesis-based data generation and research priorities in support of risk assessment. The modified framework is incorporated within a roadmap, with feedback loops encouraging continuous refinement of fit-for-purpose testing strategies and risk assessment. Important in this construct is consideration of dose-response relationships and species concordance analysis in weight of evidence. The modified Bradford Hill considerations have been updated and additionally articulated to reflect increasing experience in application for cases where the toxicological outcome of chemical exposure is known. The modified framework can be used as originally intended, where the toxicological effects of chemical exposure are known, or in hypothesizing effects resulting from chemical exposure, using information on putative key events in established modes of action from appropriate in vitro or in silico systems and other lines of evidence. This modified mode of action framework and accompanying roadmap and case examples are expected to contribute to improving transparency in explicitly addressing weight of evidence considerations in mode of action/species concordance analysis based on both conventional data sources and evolving methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,295
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,270
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,295
Score d'incertitude au seuil0,869

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2950,270
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0140,012
Études des sciences et des technologies0,0030,029
Communication savante0,0170,013
Science ouverte0,0120,012
Intégrité de la recherche0,0070,021
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations281
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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