Recombinant expression and characterization of Solanum tuberosum aspartic protease
Notice bibliographique
Résumé
Unique to aspartic proteinases from plants are the presence of approximately 100 amino acid regions, which are usually excised during activation of the zymogen. These sequences are termed ‘Plant-Specific Inserts’ and are implicated in membrane interactions of their parent enzymes, including vacuolar targeting and host defense. The need to further characterize the structure-function rol (s) of plant-specific inserts stimulated the current study of the characterization of Solanum tuberosum AP (StAP). Recombinant expression of wild-type StAP resulted in the 54 kDa protein being visualized by SDS-PAGE analysis with a protein yield of 0.03%. A protein purification factor could not be established since activation of the protein at pH 2.2, 3.0, 3.7 and 5.5 was not achieved as evidenced by a lack of change in band patterns on SDS-PAGE as well as acidification and hemoglobin degradation assays. To potentially improve enzyme folding and activation ability, two mutants, (1) lacking the pre-signal sequence and (2) lacking both the signal sequence and the prosegment, were designed, sub-cloned, and expressed. Both products proved to be insoluble and inactive. New constructs were designed for the expression of StAP inclusion bodies for insoluble expression and subsequent re-folding of the protein. Additionally, CysAla mutations for each PSI Cys residue were made to investigate the rol (s) of plant-specific insert disulfide bonds in plant aspartic proteinase enzyme folding and structure. All PSI cysteine mutations (eight mutants) were successfully created using QuickChange MutagenesisTM
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».