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Enregistrement W1883315785

RAPID DETECTION OF SWINE TRANSMISSIBLE GASTROENTERITIS VIRUS BY NESTED POLYMERASE CHAIN REACTION

2008· article· en· W1883315785 sur OpenAlexaff
Edisleidy Rodríguez, Alejandro Mohar Betancourt, Maritza Barrera, Changee Lee, Dongwan Yoo

Notice bibliographique

RevueRevista de salud animal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyNested polymerase chain reactionPolymerase chain reactionBiologyVirusGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this study was to develop a nested PCR for the rapid detection of TGEv. The primers were designed from the highly conserved regions of several sequences of this virus included in the analysis. With the purpose of achieving a good technical specificity, sequences of porcine epidemic diarrhoea virus (PEDv) were included in the design. This virus belongs to the same viral family and it has a close genetic relationship with TGEv. Since both viruses produce the same clinical signs, it was very important to get primers which not amplify PEDv. With the external primers, the amplification of a fragment of the expected size (441 pb) in all the samples evaluated by RT-PCR was obtained, but there was a very low intensity. In the second round (nested PCR), with the internal primers, the amplification of a fragment of the expected size of 168 pb was shown, with a very good concentration. It has been considered that when using nested PCR, TGEv detection sensitivity increased in isolates with low viral concentration. (

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,564
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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