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Enregistrement W1893342109 · doi:10.1002/9781119951438.eibc2133

Nickel Homeostasis: Mechanism and function of<scp>NikR</scp>

2004· other· en· W1893342109 sur OpenAlexaff
Michael D. Jones, Andrew M. Sydor, Deborah B. Zamble

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry · 2004
Typeother
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryDNARepressorTranscription (linguistics)Transcription factorFunction (biology)Cell biologyNickelBacteriaArchaeaIntracellularBiophysicsBiochemistryBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Nickel plays an important role in many organisms as a cofactor of enzyme active sites. However, nickel ions can be toxic and therefore require a robust regulation system. Found in a wide variety of bacteria and archaea, NikR is a transcription factor that regulates intracellular nickel homeostasis. The activities of NikR homologs from several microorganisms have been examined in detail both in vitro and in vivo. Ni 2+ loading promotes DNA binding by NikR , an activity supplemented by additional, homolog‐specific cation requirements. Furthermore, there is evidence that the mechanism of nickel‐activated DNA binding includes stabilization of secondary structural elements of the protein that promote the formation of nonspecific DNA contacts. Although a key function of NikR is to regulate nickel uptake, the extent of its influence and its connection with other cellular pathways varies between organisms. Common features and contrasting activities within NikR homologs are presented and major outstanding questions are described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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