The Human Immune System Recognizes Neopeptides Derived from Mitochondrial DNA Deletions
Notice bibliographique
Résumé
Mutations in mitochondrial (mt) DNA accumulate with age and can result in the generation of neopeptides. Immune surveillance of such neopeptides may allow suboptimal mitochondria to be eliminated, thereby avoiding mt-related diseases, but may also contribute to autoimmunity in susceptible individuals. To date, the direct recognition of neo-mtpeptides by the adaptive immune system has not been demonstrated. In this study we used bioinformatics approaches to predict MHC binding of neopeptides identified from known deletions in mtDNA. Six such peptides were confirmed experimentally to bind to HLA-A*02. Pre-existing human CD4(+) and CD8(+) T cells from healthy donors were shown to recognize and respond to these neopeptides. One remarkably promiscuous immunodominant peptide (P9) could be presented by diverse MHC molecules to CD4(+) and/or CD8(+) T cells from 75% of the healthy donors tested. The common soil microbe, Bacillus pumilus, encodes a 9-mer that differs by one amino acid from P9. Similarly, the ATP synthase F0 subunit 6 from normal human mitochondria encodes a 9-mer with a single amino acid difference from P9 with 89% homology to P9. T cells expanded from human PBMCs using the B. pumilus or self-mt peptide bound to P9/HLA-A2 tetramers, arguing for cross-reactivity between T cells with specificity for self and foreign homologs of the altered mt peptide. These findings provide proof of principal that the immune system can recognize peptides arising from spontaneous somatic mutations and that such responses might be primed by foreign peptides and/or be cross-reactive with self.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».