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Enregistrement W1898339110 · doi:10.5539/ijb.v8n1p9

Preliminary Molecular Studies of the First Report of Burkholderia pseudomallei Isolation from Soil Collected in the Amapá State, in Northern Brazil

2015· article· en· W1898339110 sur OpenAlexvenueno aff
Vespasiano YK Sousa, J. F. O. Segovia, Patricia Martins, Roberto Messias Bezerra, Magda CA Gonçalves, Steeven Pereira, Deyse Christina Vallim, Ana Paula D’Alincourt Carvalho-Assef, Ernesto Hofer, L. I. B. Kanzaki

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBurkholderia infections and melioidosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBurkholderia pseudomalleiBiologyMicrobiologyMelioidosisPathogenBurkholderiaMicroorganismBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The wide spectra of colonizing microorganism, likewise Burkholderia pseudomallei, has been found in different habitats, and presenting distinct activity, as exerting physiological functions among plants, or as a pathogen for man, animals and also as a phytopathogen. A common disease of men and animals caused by B. pseudomallei, melioidosis, is a severe morbidity that usually culminates in the host death. Soil samples from different areas in the Amapá state, in northern Brazil, were screened for environmental microorganisms to assess potential antimicrobial activity aiming at biotechnological applications. Among the prospected microorganisms, B. pseudomallei was isolated from high humidity soils, mangrove, which is rich in organic materials, produced by the diversified local flora and fauna. The isolated B. pseudomallei was identified by its biochemical profile and growth characteristics. Molecular confirmation of B. pseudomallei phenotypic identification was achieved by PCR amplification of the 16 S ribosomal DNA. The sequencing of amplified products confirmed that the Amapá sample, and two other isolates from human infections in Ceará state, northeast Brazil, were B. pseudomallei, and sequence alignement to the same specie, MSHR146 strain from Australia, and clone YN01 from uncultured Burkholderia sp., deposited in the GenBank, exhibited close phylogenetic relationship among them. Until now, there is no report of B. pseudomallei related disease among human and animal populations in the Amapá state, despite the finding of B. pseudomallei in it, in an area of water buffalo ranching and flowing small rivers utilized by human populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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