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Enregistrement W1900865616

CONFIRMATION OF MELOIDOGYNE HAPLA ON STRAWBERRY IN FLORIDA USING MOLECULAR AND MORPHOLOGICAL TECHNIQUES [IDENTIFICACIÓN DEL NEMATODE NODULADOR MELOIDOGYNE HAPLA, EN FRESA EN FLORIDA MEDIANTE MÉTODOS MORFOLÓGICOS Y MOLECULARES]]

2012· article· es· W1900865616 sur OpenAlexaboutno aff
T. W. Nyoike, Tesfamariam Mekete, Robert McSorley, Elke Weibelzahl-Karigi, Oscar E. Liburd

Notice bibliographique

RevueNematropica · 2012
Typearticle
Languees
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNematodeGenBankRoot-knot nematodeFragariaHorticultureRibosomal DNABotanyNematode infectionPhylogeneticsEcologyGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nyoike, T.W., T. Mekete, R. McSorley, E. Weibelzahl-Karigi, and O. E. Liburd. 2012. Identification of the root-knot nematode, Meloidogyne hapla, on strawberry in Florida using morphological and molecular methods. Nematropica 42:253-259. Morphological and molecular studies were conducted to identify a root-knot nematode that was found on strawberry roots growing in Marion County, Florida, and on strawberry transplants imported from nurseries in Ontario, Canada. In early spring 2011, strawberry plants growing in the field were observed showing localized stunting and galled roots. Soil samples collected from the field revealed a very high number of Meloidogyne infective juveniles (232 J2/100cc soil) in one block but relatively low numbers in two other blocks. Morphological studies based on perineal patterns of root-knot females collected from the field-strawberry roots and from strawberry transplants (received from nurseries in October 2011) were conducted. The perineal patterns indicated that they were Meloidogyne hapla Chitwood. Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification of the region between COII and 16S rRNA of the mitochdrial DNA produced a single fragment ca 540 bp. Restriction digestion of the amplified PCR products with Dra1 enzyme produced two fragments at 200 and 250 bp indicating that the root-knot nematode in the field and on transplant strawberry plants was M. hapla. DNA sequencing of the internal transcribed spacer (ITS) region produced a single fragment ca 990 bp and a BLAST search in the Genbank revealed that the species was 98% identical to other known M. hapla sequences in the Genbank. This study ascertains that M. hapla recorded on strawberry plants in the field was imported with the transplants from the nurseries in Ontario, Canada. M. hapla, is commonly found in cooler climates and high altitudes, and has been reported as a common pest for strawberries in northeastern United States. Implications of importing nematode-infected strawberry transplants are discussed. Nyoike, T.W., T. Mekete, R. McSorley, E. Weibelzahl-Karigi, and O. E. Liburd. 2012. Identificacion del nematode nodulador Meloidogyne hapla, en fresa en Florida mediante metodos morfologicos y moleculares. Nematropica 42:253-259. Se realizaron estudios morfologicos y moleculares para identificar un nematodo agallador encontrado en raices de fresa en el condado de Marion, Florida y en trasplantes de fresa importados de viveros de Ontario, Canada. A principios de la primavera de 2011, se observaron en el campo rodales de plantas de fresa con enanismo y raices agalladas. Muestras de suelo recolectadas de este campo revelaron un numero muy alto de juveniles infectivos de Meloidogyne (232 J2/100cc suelo) en uno de los bloques pero relativamente bajo en los otros dos bloques. Se llevaron a cabo estudios morfologicos basados en el patron perineal de las hembras del nematodo utilizando muestras de raices de fresa recolectadas en el campo y raices de trasplantes de fresa (recibidos de viveros en Octubre 2011). El patron perineal indico que las hembras eran Meloidogyne hapla Chitwood. La amplificacion de la region entre COII y el 16S rRNA del DNA mitocondrial mediante la reaccion en cadena de la polimerasa produjo un solo fragmento de aprox. 540 bp. La digestion del producto amplificado de la PCR con la enzima Dra1 produjo dos fragmentos a 200 y 250 bp, lo que indicaba que la especie de Meloidogyne encontrada en el campo y en los trasplantes era M. hapla. La secuenciacion del DNA de la region ITS confirmo la identidad de M. hapla con un 98% de similitud con otras especies conocidas de M. hapla depositadas en el Genbank. Este estudio confirma que M. hapla en las plantas de fresa en el campo fue importada con los trasplantes procedentes de Ontario, Canada. M. hapla se encuentra comunmente en climas mas frios y altitudes altas y se ha citado como una plaga comun de la fresa en el noreste de los Estados Unidos de America. Se discute las implicaciones de importar trasplantes de fresa infestados con el nematodo agallador.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,526
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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