Molecular Evolution and Phylogenomics of the <i>Anopheles gambiae</i> Complex
Notice bibliographique
Résumé
Malaria vectors of the Anopheles gambiae complex are made up six species of mosquitoes that are stable and are highly efficient vectors. This group comprises of major and minor vectors, some of which are responsible for transmission of the most deadly strain of malaria parasite, Plasmodium falciparum . The evolutionary history of this species group was inferred using publically available DNA sequence data. The retrieved sequences were aligned using CLUSTAL W; evolutionary history was inferred using Maximum Likelihood, Neighbor-Joining, and Minimum Evolution methods. Ancestral sequences were also inferred using the FASTML Server-based program for computing ancestral sequences. Based on morphology, ecology and behaviour, Anopheles gambiae and Anopheles arabiensis (major vectors) were found to evolve from a common ancestor. All the members of this complex were all AT rich. A. gambiae and A. arabiensis had the highest AT composition, while A. merus was the least AT rich among the complex. Evolutionary divergence estimates show that these two major vectors are genetically similar. A. quadriannulatus (non vector) and A. melas (minor vector) were also found to evolve from the same ancestor. Overall, this study gives an understanding of the ancestral lineage of the A. gambiae complex, which will be essential for understanding the origins, evolution, classification and epidemiology of this important disease vector. This may have important implications for the control of malaria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».