Promotion of the neutralization-competent structure of the HIV-1 gp41 membrane proximal external region when tethered to its native transmembrane domain, and expressed in the context of the plasma membrane: implications for vaccine design (53.24)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The limited success of vaccines targeting the MPER, a target of three broadly neutralizing (bNt) monoclonal antibodies (MAbs), we hypothesize, reflects the difficulty of mimicking the neutralization-competent structure (NCS) of the MPER. We determined the contribution of the amino-acid sequence and the transmembrane domain (TM), to the antigenicity of the MPER in the context of the plasma membrane. DNA constructs encoding various gp41 ectodomain fragments, and the TM of either the platelet-derived growth factor receptor (PGDFR), or that of gp41, were produced and transiently expressed in COS-7 cells. Constructs expressing the MPER tethered to the gp41 TM followed by a 27-residue cytoplasmic tail fragment, MPER-TM1, produced optimal binding of MAbs 2F5, 4E10 and Z13e1. A series of 24 single amino-acid substitutions in the MPER-TM1 revealed critical binding residues for the three MAbs; similar substitutions were previously shown to ablate Ab-mediated viral neutralization. Neutralization-incompetent 2F5 Fab and 4E10 IgG mutant Abs failed to bind MPER-TM1, yet retained the ability to bind to peptide epitopes, indicating the plasma-membrane expressed MPER-TM1 closely approaches the NCS of the MPER. Substitution of the TM of gp41 with that from the PGDFR reduced binding by MAb 4E10, but not MAbs 2F5 or Z13e1. Our studies reveal that the gp41 TM appears to play a pivotal role both in orienting the 4E10 epitope, and affecting exposure of the MPER epitopes for all three bNtMAbs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».