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Enregistrement W1911162384 · doi:10.1002/3527600906.mcb.201100039

Protein Abundance Variation

2012· reference-entry· en· W1911162384 sur OpenAlexaff
Greco Hernández, Gritta Tettweiler

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine · 2012
Typereference-entry
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGene expressionAbundance (ecology)GeneComputational biologyRegulation of gene expressionGeneticsGenomeProtein degradationProtein biosynthesisEvolutionary biologyCell biologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In all forms of life, the amount of cellular protein present at any given time is tightly regulated by a combination of mechanisms of gene expression, namely transcription, mRNA degradation, translation, and protein degradation. A variety of events can trigger changes in protein abundance throughout the cell cycle by affecting the different steps of gene expression. Although the mechanisms that regulate gene expression in prokaryotes and eukaryotes are well known, the way in which protein abundance is controlled at each regulatory step remains unclear. The quantitation of protein levels is essential to understand the different aspects of gene expression, while a solid knowledge of the mechanisms and causes that affect protein levels should enable the development of new technologies, whether for human needs or environmental care. In the past, considerable effort has been invested in quantifying protein abundances in different situations such as stress, disease progression, or changing environmental conditions. More recently, significant advances have been made in the methods used to quantify protein abundance on the genome scale, in specific cells at certain time points, and/or under different environmental conditions. In this chapter, the different mechanisms that control protein abundance variation in prokaryotes and eukaryotes – that is, the biochemical features of mRNAs and proteins, as well as external factors such as environmental changes, stress, diseases, or developmental stages – are reviewed. Details are also be provided of the most relevant methodologies for the qualitative and quantitative analyses of protein abundance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,761
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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