Populations of uncultivated American cranberry in sphagnum bog communities harbor novel assemblages of Actinobacteria with antifungal properties
Notice bibliographique
Résumé
The American cranberry (Vaccinium macrocarpon Aiton) is a perennial plant in northern latitudes that co-occurs with sphagnum mosses in uncultivated populations, in habitats characterized by high acidity, low nitrogen, and fungal pathogens that thrive in wet environments. We investigated the association of Actinobacteria with cranberry and co-inhabiting sphagnum moss and their antifungal properties, across several natural populations. Based on 16S-rRNA gene phylogeny, the majority of these species were in the genus Streptomyces. Neither site nor plant source explained the phylogenetic relationships of these isolates. Most sequences did not group with known Streptomyces sequences, indicating a potentially high diversity of novel strains from this environment. We observed antibiosis by some Actinobacteria isolates against the phytopathogenic fungus Colletotrichum acutatum and a general antagonistic fungus, Trichoderma sp. Individual isolates varied in antifungal ability within and between fungi. Variation in bacterial antifungal properties was not explained by plant species or site, but was partially related to phylogenetic relationship. These results document novel associations between cranberry and sphagnum moss with Actinobacteria, including strains capable of inhibiting fungi. These results suggest candidates for development as biological control agents in agriculture.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».