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Enregistrement W191409454 · doi:10.1007/978-1-62703-383-1_4

Fluorescent Biosensors for the Detection of HMGB1 Release

2013· article· en· W191409454 sur OpenAlexfundno aff
Isabelle Martins, Oliver Kepp, Laurie Menger, Mickaël Michaud, Sandy Adjemian, Abdul Qader Sukkurwala, Erika Vacchelli, Lorenzo Galluzzi, Guido Kroemer

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Glycation End Products research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National Du CancerLigue Contre le CancerInstitute of Cancer ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésHMGB1Programmed cell deathExtracellularCell biologyImmune systemTransfectionCellGreen fluorescent proteinBiologyApoptosisImmunogenic cell deathCancer cellIn vivoChemistryCell cultureBiochemistryCancerReceptorImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During necrosis and following some instances of apoptosis (in particular in the absence of a proficient phagocytic system), the nonhistone chromatin component high-mobility group box 1 (HMGB1) is released in the extracellular space. In vivo, extracellular HMGB1 can bind Toll-like receptor 4 on the surface of dendritic cells, de facto operating as a danger-associated molecular pattern and alarming the organism to the presence of stressful conditions. Recent results indicate that the release of HMGB1 is one of the key features for cell death to be perceived as immunogenic, i.e., to be capable of triggering a cognate immune response in vivo. Thus, only anticancer agents that-among other features-allow for the release of HMGB1 as they induce cell death are expected to stimulate anticancer immune responses. To investigate the immunogenic potential of conventional anticancer agents and novel cell death inducers on a high-throughput scale, we engineered human osteosarcoma U2OS cells to express HMGB1 fused at the N-terminus of the green fluorescent protein (GFP). Coupled to fluorescence microscopy workstations for automated image acquisition and analysis, this HMGB1-GFP-based biosensor is amenable for the identification of potential inducers of immunogenic cell death among large chemical libraries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,381 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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