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Enregistrement W1922784450

ELUCIDATING THE INTERACTIONS OF THE GOLGI ASSOCIATED RETROGRADE PROTEIN (GARP) COMPLEX IN ARABIDOPSIS THALIANA.

2015· dissertation· en· W1922784450 sur OpenAlexfundno aff
Ryan Moedt

Notice bibliographique

RevueOpen ULeth Scholarship (OPUS) (University of Lethbridge) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotanical Research and Chemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Lethbridge
Mots-clésArabidopsis thalianaGolgi apparatusBiologyArabidopsisComputational biologyCell biologyBiochemistryGeneMutant
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants contain a diversified endomembrane system and transport within the network requires efficient and accurate vesicle transport. Tethering factors represent a group of loosely related proteins and protein complexes that act to physically link vesicles to the target membrane. UNH was previously identified as the VPS51 homolog of the Golgi-associated retrograde protein (GARP) complex, known to tether vesicles in endosome to trans-golgi network (TGN) retrograde transport. The unh cellular phenotype is similar to secretion/vacuole defects observed in yeast and metazoan GARP complex mutants suggesting a conserved function in plants. This study was designed to assess whether the Arabidopsis GARP complex members participate in similar protein interactions as found in other eukaryotes. All of the plant GARP subunits contain predicted N-terminal coiled coils, important for interaction in other organisms. We show through deletional mutagenesis that these predicted N-terminal coiled coils are required for UNH to interact with VPS52 in vivo via yeast two-hybrid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,915
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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