ELUCIDATING THE INTERACTIONS OF THE GOLGI ASSOCIATED RETROGRADE PROTEIN (GARP) COMPLEX IN ARABIDOPSIS THALIANA.
Notice bibliographique
Résumé
Plants contain a diversified endomembrane system and transport within the network requires efficient and accurate vesicle transport. Tethering factors represent a group of loosely related proteins and protein complexes that act to physically link vesicles to the target membrane. UNH was previously identified as the VPS51 homolog of the Golgi-associated retrograde protein (GARP) complex, known to tether vesicles in endosome to trans-golgi network (TGN) retrograde transport. The unh cellular phenotype is similar to secretion/vacuole defects observed in yeast and metazoan GARP complex mutants suggesting a conserved function in plants. This study was designed to assess whether the Arabidopsis GARP complex members participate in similar protein interactions as found in other eukaryotes. All of the plant GARP subunits contain predicted N-terminal coiled coils, important for interaction in other organisms. We show through deletional mutagenesis that these predicted N-terminal coiled coils are required for UNH to interact with VPS52 in vivo via yeast two-hybrid.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».