A rapid method for the isolation of untouched naive CD8 T cells from peripheral blood mononuclear cells (46.9)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Naïve CD8 T cells are, by definition, those that have been released by the thymus into circulation, but have not yet encountered their cognate antigens. Once they become activated they proliferate and generate effector T cells. We describe an easy and rapid method for the isolation of untouched naïve CD8 T cells from peripheral blood mononuclear cells (PBMC). Briefly, PBMCs are isolated by Ficoll-Paque PLUS density gradient sedimentation. Naïve CD8 T cells are then enriched using immunomagnetic, column-free, negative selection (EasySep™). Using EasySep™, unwanted cells are removed using antibody complexes recognizing non-naïve CD8 T cells and dextran-coated magnetic particles. Labeled cells are separated by placing the tube in an EasySep™ magnet. This procedure can be fully automated using RoboSep™. EasySep™ isolated naïve CD8 T cells are assessed by flow cytometry using a combination of antibodies specific for naïve, effector and memory cells. Naïve CD8 T cells are defined as CD8+CD45RA+CCR7+ and CD45RO-CD56-CD57-. Starting with PBMCs isolated from fresh blood and buffy coat, purities of 89±3% (n=8) are obtained (starting cell frequency 1.0-11.2%). EasySep™ isolated naïve CD8 T cells undergo robust proliferation as measured by flow cytometry of CFSE-labeled cells in culture with CD3/28 T cell expander beads. This simple method to isolate naïve CD8 T cells will be invaluable to researchers studying T cell differentiation, autoimmunity and infectious diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,028 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».