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Enregistrement W1926170905 · doi:10.1111/j.2042-7158.2010.01161.x

Exploring neurotherapeutic space: how many neurological drugs exist (or could exist)?

2010· article· en· W1926170905 sur OpenAlexafffund
Donald F. Weaver, Colin Weaver

Notice bibliographique

RevueJournal of Pharmacy and Pharmacology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChemical spaceDruggabilityVirtual screeningNeurochemicalNeuroactive steroidDrug discoverySpace (punctuation)ChemistryNeuroscienceComputational biologyComputer sciencePsychologyReceptorBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Since high-throughput screening of compound libraries (virtual or real) against druggable targets is increasingly being used to discover therapies for brain disorders, it is crucial to ascertain if such screening methods adequately explore 'neurotherapeutic space (i.e. the total number of molecules that are or could be neuroactive)'. We present an approach to providing an estimate of the size of neurotherapeutic space. METHODS: Molecular modelling and statistical calculations were used to determine the number of molecules, which exist or could exist, with the necessary physicochemical and structural properties to be neurologically active drugs. KEY FINDINGS: Assuming eight fundamental types of drug-receptor interactions, five different functional groups per type of interaction and five different molecular platforms for each functional group array, we calculated the total number of molecules that could be contained within a 7 Å radius sphere, used to define neuroactive chemical space. This calculation revealed that there are 6 × 10(15) molecules that could be neurological drugs. CONCLUSIONS: Clearly, when it comes to exploring neurochemical space, we are still in our infancy and conventional high-throughput screening provides only a very limited sampling of the neuroactive chemical space that is available to neurotherapeutic compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,152
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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