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Enregistrement W1928008970 · doi:10.4049/jimmunol.169.10.5571

Human MHC Class I Transgenic Mice Deficient for H2 Class I Expression Facilitate Identification and Characterization of New HLA Class I-Restricted Viral T Cell Epitopes

2002· article· en· W1928008970 sur OpenAlexaff
Eve Cheuk, Celine D’Souza, Ningjie Hu, Youan Liu, Haili Lang, John W. Chamberlain

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenToronto Rehabilitation InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeCTL*Human leukocyte antigenBiologyMHC class ICD8Beta-2 microglobulinMajor histocompatibility complexT cellVirologyCytotoxic T cellMolecular biologyImmunologyAntigenGeneticsImmune systemIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although mice transgenic (Tg) for human MHC (HLA) class I alleles could provide an important model for characterizing HLA-restricted viral and tumor Ag CTL epitopes, the extent to which Tg mouse T cells become HLA restricted in the presence of endogenous H2 class I and recognize the same peptides as in HLA allele-matched humans is not clear. We previously described Tg mice carrying the HLA-B27, HLA-B7, or HLA-A2 alleles expressed as fully native (HLA(nat)) (with human beta(2)-microglobulin) and as hybrid human/mouse (HLA(hyb)) molecules on the H2(b) background. To eliminate the influence of H2(b) class I, each HLA Tg strain was bred with a H2-K(b)/H2-D(b)-double knockout (DKO) strain to generate mice in which the only classical class I expression was the human molecule. Expression of each HLA(hyb) molecule and HLA-B27(nat)/human beta(2)-microglobulin led to peripheral CD8(+) T cell levels comparable with that for mice expressing a single H2-K(b) or H2-D(b) gene. Influenza A infection of Tg HLA-B27(hyb)/DKO generated a strong CD8(+) T cell response directed at the same peptide (flu nucleoprotein NP383-391) recognized by CTLs from flu-infected B27(+) humans. As HLA-B7/flu epitopes were not known from human studies, we used flu-infected Tg HLA-B7(hyb)/DKO mice to examine the CTL response to candidate peptides identified based on the B7 binding motif. We have identified flu NP418-426 as a major HLA-B7-restricted flu CTL epitope. In summary, the HLA class I Tg/H2-K/H2-D DKO mouse model described in this study provides a sensitive and specific approach for identifying and characterizing HLA-restricted CTL epitopes for a variety of human disease-associated Ags.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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