<i><scp>S</scp>higella flexneri</i> serotype 1 infections in men who have sex with men in <scp>V</scp>ancouver, <scp>C</scp>anada
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Outbreaks of shigellosis have been documented in men who have sex with men (MSM), associated with interpersonal transmission and underlying HIV infection. We observed a rise in Shigella flexneri isolates identified in a downtown tertiary-care hospital laboratory located within the city centre community health area (CHA-1) of Vancouver, Canada. The objectives of this study were to evaluate clinical outcomes of shigellosis cases among MSM admitted to hospital and to evaluate trends in Shigella cases within Vancouver, Canada. METHODS: Adult rates of shigellosis were analysed by gender and health region, from 2005 to 2011, followed by retrospective chart review of all hospital laboratory-identified S. flexneri cases from 2008 to 2012. Serotyping and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) were performed on these isolates. RESULTS: Although shigellosis rates in men within CHA-1 did not change from 2005 to 2011 (range 33.4-68.5 per 100 000; P = 0.74), they were significantly higher than in other regions within the city of Vancouver (P ≤ 0.001) and the province of British Columbia (P ≤ 0.001). Shigella flexneri rates in men within CHA-1 increased significantly (range 2.3-51.4 per 100 000; P < 0.001), starting in 2008, and were higher than in other regions within Vancouver (P ≤ 0.01). Seventy-nine isolates of S. flexneri from 72 patients were identified by a single hospital laboratory. All patients were male and predominantly MSM (91.7%) and HIV-infected (86.1%), with most (92.6%) demonstrating CD4 counts ≥ 200 cells/μL. In total, 38.0% required hospitalization. Most (87.3%) had S. flexneri serotype 1 infection, with 72.9% of these representing a single PFGE pattern. CONCLUSIONS: We identified high levels of transmission of a primarily clonal strain of S. flexneri serotype 1 in our local MSM population, resulting in a substantial burden of illness and health care resource use secondary to hospital admissions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».