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Enregistrement W1931417789 · doi:10.1111/hiv.12191

<i><scp>S</scp>higella flexneri</i> serotype 1 infections in men who have sex with men in <scp>V</scp>ancouver, <scp>C</scp>anada

2015· article· en· W1931417789 sur OpenAlexaffabout
Amanda Wilmer, MG Romney, Réka Gustafson, Jat Sandhu, Tianxin Chu, Corrinne Ng, Linda Hoang, S. Champagne, M Hull

Notice bibliographique

RevueHIV Medicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensBC Centre for Disease ControlVancouver Coastal HealthAIDS VancouverSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésShigellosisShigella flexneriMedicineSerotypeMen who have sex with menOutbreakInternal medicineShigellaDemographyVirologyHuman immunodeficiency virus (HIV)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Outbreaks of shigellosis have been documented in men who have sex with men (MSM), associated with interpersonal transmission and underlying HIV infection. We observed a rise in Shigella flexneri isolates identified in a downtown tertiary-care hospital laboratory located within the city centre community health area (CHA-1) of Vancouver, Canada. The objectives of this study were to evaluate clinical outcomes of shigellosis cases among MSM admitted to hospital and to evaluate trends in Shigella cases within Vancouver, Canada. METHODS: Adult rates of shigellosis were analysed by gender and health region, from 2005 to 2011, followed by retrospective chart review of all hospital laboratory-identified S. flexneri cases from 2008 to 2012. Serotyping and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) were performed on these isolates. RESULTS: Although shigellosis rates in men within CHA-1 did not change from 2005 to 2011 (range 33.4-68.5 per 100 000; P = 0.74), they were significantly higher than in other regions within the city of Vancouver (P ≤ 0.001) and the province of British Columbia (P ≤ 0.001). Shigella flexneri rates in men within CHA-1 increased significantly (range 2.3-51.4 per 100 000; P < 0.001), starting in 2008, and were higher than in other regions within Vancouver (P ≤ 0.01). Seventy-nine isolates of S. flexneri from 72 patients were identified by a single hospital laboratory. All patients were male and predominantly MSM (91.7%) and HIV-infected (86.1%), with most (92.6%) demonstrating CD4 counts ≥ 200 cells/μL. In total, 38.0% required hospitalization. Most (87.3%) had S. flexneri serotype 1 infection, with 72.9% of these representing a single PFGE pattern. CONCLUSIONS: We identified high levels of transmission of a primarily clonal strain of S. flexneri serotype 1 in our local MSM population, resulting in a substantial burden of illness and health care resource use secondary to hospital admissions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,144
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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