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Enregistrement W1932286144 · doi:10.1111/his.12723

Impact of the 2013 <scp>A</scp>merican <scp>S</scp>ociety of <scp>C</scp>linical <scp>O</scp>ncology/<scp>C</scp>ollege of <scp>A</scp>merican <scp>P</scp>athologists guideline recommendations for human epidermal growth factor receptor 2 (<scp>HER</scp>2) testing of invasive breast carcinoma: a focus on tumours assessed as ‘equivocal’ for <scp>HER</scp>2 gene amplification by fluorescence <i>in‐situ</i> hybridization

2015· article· en· W1932286144 sur OpenAlexaff
Gillian Bethune, Daniel Veldhuijzen van Zanten, Rebecca F. MacIntosh, Daniel Rayson, Tallal Younis, Kara Thompson, Penny J. Barnes

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensCapital District Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerInternal medicineHuman Epidermal Growth Factor Receptor 2PathologicalOncologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The updated 2013 American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists (ASCO/CAP) human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) testing guidelines include changes to HER2 in-situ hybridization (ISH) interpretation criteria. We conducted a retrospective review of a consecutive cohort of primary breast carcinomas to assess the impact of updated guidelines on HER2 classification and laboratory resource utilization, and to characterize the pathobiology of HER2 equivocal tumours. METHODS AND RESULTS: A total of 904 dual-probe HER2/chromosome enumeration probe (CEP17) FISH tests on invasive breast carcinomas were studied. Eighty-five (9.4%) cases had a classification change with the updated guidelines; 66 (7.3%) went from HER2-negative to -equivocal, 15 cases (1.7%) were reclassified as HER2-positive and four cases from HER2-equivocal to -negative. A subset of primary breast cancers, reported initially as HER2-negative but -equivocal by 2013 guidelines, was identified. Traditional pathological factors of this subset were compared to HER2-negative and -positive control cases. The three HER2 groups demonstrated statistically significant differences with respect to prognostic factors, including tumour size, grade and nodal involvement. CONCLUSIONS: The updated HER2 testing guidelines will result in the reclassification of approximately 9.4% of primary breast cancers with uncertainty regarding the clinical impact of this reclassification in the majority of cases. Resource utilization will increase as a result of the recommendation for retesting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,160

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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