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Enregistrement W1937690720

Computational modeling and biological evaluation of methylated (-)-EGCG analogs

2006· article· en· W1937690720 sur OpenAlexaff
Kristin R. Landis‐Piwowar, Sheng Wan, Kenyon G. Daniel, Di Chen, Tak Hang Chan, Q. Ping Dou

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTea Polyphenols and Effects
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteasomeMethylationChemistryBiochemistryIn vitroIn silicoJurkat cellsPolyphenolApoptosisStereochemistryPharmacologyBiologyAntioxidantT cellGeneImmunology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proc Amer Assoc Cancer Res, Volume 47, 2006 4897 The anti-cancer and cancer-preventive effects of green tea and its main constituent (-)-epigallocatechin-3-gallate [(-)-EGCG] are well documented by a variety of studies, including epidemiological, cell culture, animal, and clinical. While (-)-EGCG remains the most potent polyphenol in green tea, it is particularly unstable under neutral or alkaline conditions ( i.e . physiologic pH) and may be modified by methylation, glucuronidation and sulfonation. In order to understand the significance of methylation on cancer-preventative effects of tea polyphenols, we synthesized several (-)-EGCG and (-)-ECG analogs with various number of methyl groups (mono-, di-, and tri-) attached to the B- and/or D-rings. Additionally, we synthesized putative prodrugs that contain protective peracetate groups (removable by cellular cytosolic esterases) in place of the remaining hydroxyl groups. The structure-activity relationships (SARs) were studied by both in silico computational modeling of the methylated (-)-EGCG analogs to the proteasome active site and their in vitro inhibitory potencies against a purified 20S proteasome. While the number of methyl groups was increased, a gradual decrease was observed in the probability of methylated (-)-EGCG analogs to bind in silico to the active site of the proteasome. Consistently, as the number of methyl groups increased on the (-)-EGCG molecule, the in vitro proteasome-inhibitory potencies were also decreased. When human leukemic Jurkat T cells were tested, the pro-drug of the mono-methylated (-)-EGCG analog caused greater proteasome inhibition and apoptosis than the pro-drug of the tri-methylated (-)-EGCG analog. Our data suggest that methylation of (-)-EGCG lessens its proteasome-inhibitory ability that might lead to decreased cancer preventative effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,561
Score d'incertitude au seuil0,188

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,286
Tête enseignante GPT0,501
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
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Résumé présentoui

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