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Enregistrement W1937800286 · doi:10.1111/cts.12275

Sodium Channel Inhibitors Reduce DMPK mRNA and Protein

2015· article· en· W1937800286 sur OpenAlexafffund
Luke Witherspoon, Sean O’Reilly, Jeremiah Hadwen, Nafisa Tasnim, Alex MacKenzie, Faraz Farooq

Notice bibliographique

RevueClinical and Translational Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensAgricultural Research Institute of OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsU.S. Public Health ServiceCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of OttawaSpinal Muscular Atrophy Foundation
Mots-clésSodium channelMessenger RNAMedicinePharmacologyComputational biologyBiologyChemistryBioinformaticsInternal medicineSodiumBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is caused by an expanded trinucleotide (CTG)n tract in the 3' untranslated region (UTR) of the dystrophia myotonica protein kinase (DMPK) gene. This results in the aggregation of an expanded mRNA forming toxic intranuclear foci which sequester splicing factors. We believe down-regulation of DMPK mRNA represents a potential, and as yet unexplored, DM1 therapeutic avenue. Consequently, a computational screen for agents which down-regulate DMPK mRNA was undertaken, unexpectedly identifying the sodium channel blockers mexiletine, prilocaine, procainamide, and sparteine as effective suppressors of DMPK mRNA. Analysis of DMPK mRNA in C2C12 myoblasts following treatment with these agents revealed a reduction in the mRNA levels. In vivo analysis of CD1 mice also showed DMPK mRNA and protein down-regulation. The role of DMPK mRNA suppression in the documented efficacy of this class of compounds in DM1 is worthy of further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,636
Score d'incertitude au seuil0,289

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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