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Enregistrement W1938624081 · doi:10.1186/2046-2530-4-s1-p33

Effects of the novel formin INF1 on ciliogenesis

2015· article· en· W1938624081 sur OpenAlexaff
Sarah J. Copeland, C Tenneson, Wojciech A. Kulacz, J. Copeland

Notice bibliographique

RevueCilia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCiliogenesisBiologyForminsCell biologyEvolutionary biologyComputational biologyNeuroscienceGeneticsCellCilium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INF1 is a novel member of the formin family of cytoskeletal regulatory proteins. We previously identified a connection between INF1 expression and microtubule acetylation and more recently have found that INF1 expression induces Golgi dispersion. Given the dependence of ciliogenesis on microtubule acetylation and Golgi-dependent trafficking we wished to determine the effects of INF1 expression on cilia formation. Transient transfection was used to express a series of INF1 derivative in NIH 3T3 cells and the effects on cilia formation, cilia length and Golgi dispersion were monitored by immunofluorescence. Anti-acetylated tubulin was used to visualize cilia and anti-Giantin was used to visualize Golgi morphology. INF1 expression inhibited ciliogenesis in the majority of NIH 3T3 fibroblasts, however, inhibition of ciliogenesis was not connected to INF1-induced Golgi dispersion. A minority of INF1-expressing cells did form cilia and these were greatly elongated, the longest exceeding 70mm. A series of INF1 deletion derivatives were used to show that both inhibition of cilia formation and the induction of cilia elongation were dependent upon both the FH2 and microtubule-binding domains of INF1. The effects of INF1 expression on ciliogenesis were separate from its effects on Golgi-dispersion suggesting that Golgi untethering does not always inhibit ciliogenesis. The morphology of the elongated cilia formed in INF1 expressing cells is consistent with defects in dynein function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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