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Enregistrement W194680597 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a655-b

The mouse phosphatidylethanolamine <i>N</i> ‐methyltransferase is regulated transcriptionally during hepatic perinatal development

2007· article· en· W194680597 sur OpenAlexafffundabout
Laura Cole, Dennis E. Vance

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensHeritage Medical Research ClinicUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésMolecular biologyPromoterOligonucleotideBiologyTranscription (linguistics)GeneTranscription factorResponse elementChemistryGene expressionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphatidylcholine (PC) is the predominant phospholipid in mammalian plasma lipoproteins and cellular membranes. A liver‐specific pathway for PC biosynthesis is catalyzed by phosphatidylethanolamine N ‐methyltransferase (PEMT). We have found using quantitative polymerase chain reaction that PEMT mRNA increases in the liver by 96‐fold during the perinatal period in mice. To determine regions within the Pemt promoter which are important for gene activation, we prepared sections of the Pemt promoter upstream of a luciferase reporter gene. Our preliminary data suggests that activation elements may exist between −471 and −371bp (relative to the transcriptional start site). This section of the Pemt promoter (−471 to −371bp) also binds nuclear factors from perinatal mouse liver nuclear extract as determined by electromobility shift assays (EMSA). We have identified, within this region, a conserved putative binding site (GC box) for a member of the Sp family of transcription factors. An oligonucleotide containing a GC box competed out the formation of a nuclear protein‐ Pemt promoter complex by EMSA. Furthermore, mutation of the GC box but not another region within the oligonucleotide eliminated this effect. These experiments suggest that a GC‐rich element may regulate the perinatal expression of the mouse Pemt gene. Supported by the Canadian Institutes for Health Research, the National Science and Engineering Research Council and the Alberta Heritage Foundation for Medical Research .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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