Epigenetic silencing of miR-145-5p contributes to brain metastasis
Notice bibliographique
Résumé
// Sara Donzelli 1 , Federica Mori 2 , Teresa Bellissimo 1 , Andrea Sacconi 1 , Beatrice Casini 3 , Tania Frixa 1 , Giuseppe Roscilli 4 , Luigi Aurisicchio 4 , Francesco Facciolo 5 , Alfredo Pompili 6 , Maria Antonia Carosi 3 , Edoardo Pescarmona 3 , Oreste Segatto 7 , Greg Pond 8 , Paola Muti 8 , Stefano Telera 6 , Sabrina Strano 2,8 , Yosef Yarden 9 and Giovanni Blandino 1,8 1 Translational Oncogenomics Unit, Italian National Cancer Institute ‘Regina Elena’, Rome, Italy 2 Molecular Chemoprevention Unit, Italian National Cancer Institute ‘Regina Elena’, Rome, Italy 3 Department of Pathology, Italian National Cancer Institute ‘Regina Elena’, Rome, Italy 4 Takis s.r.l., Roma, Italy 5 Unit of Thoracic Surgery, Italian National Cancer Institute ‘Regina Elena’, Rome, Italy 6 Department of Neurosurgery, Italian National Cancer Institute ‘Regina Elena’, Rome, Italy 7 Laboratory of Cell Signaling, Italian National Cancer Institute ‘Regina Elena’, Rome, Italy 8 Department of Oncology, Faculty of Health Science, McMaster University, Hamilton, Canada 9 Weizmann Institute of Science, Department of Biological Regulation, Rehovot, Israel Correspondence to: Giovanni Blandino, email: // Keywords : brain metastases; lung cancer; mir-145-5p; epigenetic modifications; migration Received : June 27, 2015 Accepted : September 14, 2015 Published : September 30, 2015 Abstract Brain metastasis is a major cause of morbidity and mortality of lung cancer patients. We assessed whether aberrant expression of specific microRNAs could contribute to brain metastasis. Comparison of primary lung tumors and their matched metastatic brain disseminations identified shared patterns of several microRNAs, including common down-regulation of miR-145-5p. Down-regulation was attributed to methylation of miR-145’s promoter and affiliated elevation of several protein targets, such as EGFR, OCT-4, MUC-1, c-MYC and, interestingly, tumor protein D52 (TPD52). In line with these observations, restored expression of miR-145-5p and selective depletion of individual targets markedly reduced in vitro and in vivo cancer cell migration. In aggregate, our results attribute to miR-145-5p and its direct targets pivotal roles in malignancy progression and in metastasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».