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Enregistrement W1956266937 · doi:10.1038/ncomms8871

Crystal structure, biochemical and cellular activities demonstrate separate functions of MTH1 and MTH2

2015· article· en· W1956266937 sur OpenAlexfundno aff
Megan Carter, Ann‐Sofie Jemth, Anna Hagenkort, Brent D. G. Page, Robert Gustafsson, Julia J. Griese, Helge Gad, Nicholas C.K. Valerie, Matthieu Desroses, Johan Boström, Ulrika Warpman Berglund, Thomas Helleday, Pål Stenmark

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseCancerfondenEuropean Synchrotron Radiation FacilityWenner-Gren Stiftelserna
Mots-clésNucleotideBiochemistryDNAEnzymeOxidative phosphorylationChemistryHEK 293 cellsSubstrate (aquarium)Cell cultureBiologyCell biologyGeneGenetics

Résumé

Deregulated redox metabolism in cancer leads to oxidative damage to cellular components including deoxyribonucleoside triphosphates (dNTPs). Targeting dNTP pool sanitizing enzymes, such as MTH1, is a highly promising anticancer strategy. The MTH2 protein, known as NUDT15, is described as the second human homologue of bacterial MutT with 8-oxo-dGTPase activity. We present the first NUDT15 crystal structure and demonstrate that NUDT15 prefers other nucleotide substrates over 8-oxo-dGTP. Key structural features are identified that explain different substrate preferences for NUDT15 and MTH1. We find that depletion of NUDT15 has no effect on incorporation of 8-oxo-dGTP into DNA and does not impact cancer cell survival in cell lines tested. NUDT17 and NUDT18 were also profiled and found to have far less activity than MTH1 against oxidized nucleotides. We show that NUDT15 is not a biologically relevant 8-oxo-dGTPase, and that MTH1 is the most prominent sanitizer of the cellular dNTP pool known to date.

Conservé avec la notice de tri, où il sert de preuve aux étiquettes ci-dessus.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Le tri à trois modèles

les 5 600 travaux triés →

Les trois modèles l'ont jugé hors champ.

strate : fund_new · poids de sondage : 1678.90 (l'échantillon est stratifié ; tout taux calculé sans le poids est faux)
Claude Opus 4.8OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Structural and cellular study separating the functions of MTH1 and MTH2/NUDT15; the object is enzyme biology.

GPT-5.6 (high)OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

The study investigates molecular functions in cancer biology rather than research itself.

Grok 4.5OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Structural and cellular biochemistry of MTH1/MTH2 enzymes; cancer biology domain research.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations115
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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