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Enregistrement W195961341 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a51

Esculatin‐4‐carboxylic acid ethyl ester: A novel class of marine‐derived anti‐SARS‐coronavirus 3CL protease inhibitors

2006· article· en· W195961341 sur OpenAlexafffund
François Jean, Pamela Hamill, Polly Chow, Meera Raj, Richard Yi Tsun Kao, Raymond J. Andersen

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProteaseCoumarinSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)CoronavirusProtease inhibitor (pharmacology)Vero cellMetabolitePotencyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BiologyChemistryNatural productPharmacologyVirologyBiochemistryEnzymeVirusIn vitroViral loadMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marine sponges, which produce a remarkable array of secondary metabolites with pharmaceutical potential, are currently under investigation for cancer/pain treatments and anti‐viral therapy. This study describes our discovery of the first small‐molecule protease inhibitor from a marine organism directed at the Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)‐associated coronovirus 3CL protease. By analogy with other coronaviruses, SARS‐CoV encodes a main protease, 3CL, that plays an essential role in the viral life cycle and is currently the prime target for development of new anti‐coronavirus agents. The inhibitory compound was identified as esculatin‐4‐carboxylic acid ethyl ester (MC8: ID 50 = 46 □ M), a novel coumarin derivative extracted from the tropical marine sponge Axinella cf. corrugata , an important model of marine organism. Using a cell‐culture‐based assay of SARS‐CoV infection, we demonstrated that MC8 is an anti‐SARS agent with an EC 50 of 112□ M and a median toxic concentration higher than 800 □M. We are currently synthesizing new analogs of the MC8 coumarin compound and are evaluating their mechanism of inhibition and anti‐SARS‐CoV effects. The results of our work underscore the importance of screening chemically diverse metabolite libraries, obtained from marine sponges, for the discovery of novel protease inhibitors with potent antiviral activities and a good therapeutic index. Supported by CIHR (F. Jean).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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