Two Glutamate Residues, Glu 208α and Glu 197β, Are Crucial for Phosphorylation and Dephosphorylation of the Active-Site Histidine Residue in Succinyl-CoA Synthetase
Notice bibliographique
Résumé
Succinyl-CoA synthetase catalyzes the reversible reaction succinyl-CoA + NDP + P(i) <--> succinate + CoA + NTP (N denoting adenosine or guanosine). The enzyme consists of two different subunits, designated alpha and beta. During the reaction, a histidine residue of the alpha-subunit is transiently phosphorylated. This histidine residue interacts with Glu 208 alpha at site I in the structures of phosphorylated and dephosphorylated Escherichia coli SCS. We postulated that Glu 197 beta, a residue in the nucleotide-binding domain, would provide similar stabilization of the histidine residue during the actual phosphorylation/dephosphorylation by nucleotide at site II. In this work, these two glutamate residues have been mutated individually to aspartate or glutamine. Glu 197 beta has been additionally mutated to alanine. The mutant proteins were tested for their ability to be phosphorylated in the forward or reverse direction. The aspartate mutant proteins can be phosphorylated in either direction, while the E208 alpha Q mutant protein can only be phosphorylated by NTP, and the E197 beta Q mutant protein can only be phosphorylated by succinyl-CoA and P(i). These results demonstrate that the length of the side chain at these positions is not critical, but that the charge is. Most significantly, the E197 beta A mutant protein could not be phosphorylated in either direction. Its crystal structure shows large differences from the wild-type enzyme in the conformation of two residues of the alpha-subunit, Cys 123 alpha-Pro 124 alpha. We postulate that in this conformation, the protein cannot productively bind succinyl-CoA for phosphorylation via succinyl-CoA and P(i).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».