Quantification of the expression and inducibility of 12 rat cytochrome P450 isoforms by quantitative RT–PCR
Notice bibliographique
Résumé
The administration of xenobiotics may significantly alter the expression of cytochromes P450 (CYPs), thereby leading to potentially toxic cellular, physiologic, and pharmacologic responses. Indeed, an important task in the development of new therapeutic entities is to evaluate efficiently and quantitatively their potential effects on the expression level of different CYPs. In this report, reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to measure basal and induced mRNA of a wide range of rat CYP isoforms. Rats (n=3 per treatment) were treated with five prototype inducers of CYP isoforms or with vehicle only. RT and PCR efficiencies were determined using appropriate RNA and DNA standards. Messenger RNA was quantified by PicoGreen standard curves and normalized to cyclophilin. Quantitative RT-PCR was used successfully to demonstrate that CYP isoforms were induced at the mRNA level following drug administration. Notably, phenobarbital resulted in significant induction of CYP2B1, CYP2B2, CYP2C6, CYP2C13, CYP2E1, CYP3A1, and CYP3A2. 3-Methylcholanthrene induced CYP1A1, CYP1A2, and CYP1B1. CYP2C11 expression was highly variable and suppressed by pyridine, whereas the expression of CYP2E1 was suppressed by dexamethasone. We demonstrated that quantitative RT-PCR can be used to evaluate efficiently the effect of compounds on the expression of a wide range of CYP isoforms. The technique is advantageous over others in that it is very sensitive, efficient and applicable to highly homologous CYP isoforms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».