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Enregistrement W1963812298 · doi:10.1016/j.nicl.2013.05.007

Multilocus genetic profiling to empower drug trials and predict brain atrophy

2013· article· en· W1963812298 sur OpenAlexfundno aff
Omid Kohannim, Xue Hua, Priya Rajagopalan, Derrek P. Hibar, Neda Jahanshad, Joshua D. Grill, Liana G. Apostolova, Arthur W. Toga, Clifford R. Jack, Michael W. Weiner, Paul M. Thompson

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesGenentechNational Institutes of HealthEisaiBayer HealthCareNorthern California Institute for Research and EducationU.S. National Library of MedicineTakeda Pharmaceutical CompanyNovartis Pharmaceuticals CorporationSynarcGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeCure Alzheimer's FundMeso Scale DiagnosticsSchering-PloughMedpaceF. Hoffmann-La RocheBioClinicaPfizerBiogenAlzheimer's AssociationAmorfix Life SciencesMerckNational Science Foundation Graduate Research Fellowship ProgramEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentAlzheimer's Drug Discovery FoundationGlaxoSmithKlineBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyAstraZenecaNational Institute on AgingAbbott LaboratoriesServierWyethUniversity of California, San DiegoU.S. Department of Veterans AffairsFoundation for the National Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésApolipoprotein EAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNeuroimagingAtrophyClinical trialOncologyDiseaseSample size determinationGenetic associationMedicineAlzheimer's diseasePsychologyGenotypeBioinformaticsInternal medicineNeuroscienceBiologyGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Designers of clinical trials for Alzheimer's disease (AD) and mild cognitive impairment (MCI) are actively considering structural and functional neuroimaging, cerebrospinal fluid and genetic biomarkers to reduce the sample sizes needed to detect therapeutic effects. Genetic pre-selection, however, has been limited to Apolipoprotein E (ApoE). Recently discovered polymorphisms in the CLU, CR1 and PICALM genes are also moderate risk factors for AD; each affects lifetime AD risk by ~ 10-20%. Here, we tested the hypothesis that pre-selecting subjects based on these variants along with ApoE genotype would further boost clinical trial power, relative to considering ApoE alone, using an MRI-derived 2-year atrophy rate as our outcome measure. We ranked subjects from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) based on their cumulative risk from these four genes. We obtained sample size estimates in cohorts enriched in subjects with greater aggregate genetic risk. Enriching for additional genetic biomarkers reduced the required sample sizes by up to 50%, for MCI trials. Thus, AD drug trial enrichment with multiple genotypes may have potential implications for the timeliness, cost, and power of trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,436
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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