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Enregistrement W1964202842 · doi:10.2509/naf2013.008.012

Uncovering chemical variability: molecular data reveal the identity of a sterile crustose lichen from the Yukon and affirm an expanded circumscription for <em>Buellia griseovirens</em>

2013· article· en· W1964202842 sur OpenAlexaboutno aff
Jessica L. Allen, James C. Lendemer

Notice bibliographique

RevueNorth American Fungi · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of Environmental BiologyNational Science Foundation
Mots-clésCladePhylogenetic treeBiologyCircumscriptionLichenCrustoseTaxonInternal transcribed spacerEvolutionary biologyMolecular phylogeneticsBotanyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Here we present the results of a study using molecular data (nrITS and mtSSU sequences) to aid in the identification of a sterile, sorediate crustose lichen from the Yukon Territory of Canada. BLASTn and megaBLAST indicated an affinity to the family Caliciaceae, specifically the Buellioideae. Molecular phylogenetic analyses of mtSSU sequences from the Caliciaceae affirmed this placement, and recovered a strongly supported clade composed of the unidentified populations and members of Buellia s.l. Internal transcribed spacer sequences of the taxon were >99% similar to two sequences of B. griseovirens , a relationship supported by additional molecular phylogenetic analyses. This is the first report of the occurrence of norstictic acid deficient populations of B. griseovirens from North America. It is also the first study to use molecular data to examine, and confirm, some of the chemical variability in B. griseovirens proposed in previous revisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,861
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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