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Enregistrement W1964497584 · doi:10.4161/cbt.6.10.4787

Novel splice isoforms of STRADα differentially affect LKB1 activity, complex assembly and subcellular localization.

2007· article· en· W1964497584 sur OpenAlexafffund
Paola A. Marignani, Kristine D. Scott, Rosanna Bagnulo, Domenico Cannone, Eleonora Ferrari, Alessandro Stella, Ginevra Guanti, Cristiano Simone, Nicoletta Resta

Notice bibliographique

RevueCancer Biology & Therapy · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondazione Cassa di Risparmio di Puglia
Mots-clésScaffold proteinHeterotrimeric G proteinHEK 293 cellsCell biologyBiologyHippo signaling pathwayKinaseGeneticsCancer researchSignal transductionCell cultureG protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STRADalpha is a pseudokinase that forms a heterotrimeric complex with the scaffolding protein MO25 and the tumor suppressor serine threonine protein kinase LKB1. Mutations in the LKB1 gene are responsible for the Peutz-Jeghers Syndrome (PJS) characterized by a predisposition to hamartomatous polyps and hyperpigmentation of the buccal mucosa. Mutations in LKB1 have also been observed in some sporadic tumours unrelated to PJS. The LKB1/STRAD/MO25 complex is involved in the regulation of numerous signaling pathways including metabolism, proliferation and cellular polarity of human intestinal epithelial cells. Cell polarization, together with tissue-restricted transcription, represents the main feature of enterocyte differentiation. Since a full-length STRADalpha transcript has not been identified thus far in these cells, we evaluated the expression of endogenous STRADalpha in five colorectal cancer cell lines characterized by their diverse ability to differentiate in vitro. We report herein the discovery of several novel splice isoforms of STRADalpha that differentially affect the kinase activity, complex assembly, subcellular localization of LKB1 and the activation of the LKB1-dependent AMPK pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,412
Score d'incertitude au seuil0,677

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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