Evaluation of D<sub>10</sub>-Leu Metabolic Labeling Coupled with MALDI−MS Analysis in Studying the Response of the Yeast Proteome to H<sub>2</sub>O<sub>2</sub> Challenge
Notice bibliographique
Résumé
An efficient D 10 -Leu metabolic-labeling method combined with isotope-ratio quantitation by MALDI-TOF MS was used to probe the response of the yeast proteome to H 2 O 2 . Control cultures correct for effects not associated with H 2 O 2 challenge. A stress-response index to H 2 O 2 (SRI H 2 O 2 ) is defined, and values are reported for seven proteins at 45−225 min following exposure to 0.4 mM H 2 O 2 . The time course of protein accumulation in unstressed cells following the H 10 - to D 10 -SCD switch suggests that proteome responses at <45 min could be monitored by addition of excess D 10 -Leu to H 10 -cultures. Keywords: metabolic labeling • D 10 -Leu • 2DE • MALDI-TOF MS • S. cerevisiae • H 2 O 2 • SRI H 2 O 2
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,021 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».