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Enregistrement W1964830884 · doi:10.1002/psc.1337

Examination of the active secondary structure of the peptide 101.10, an allosteric modulator of the interleukin‐1 receptor, by positional scanning using β‐amino γ‐lactams

2011· article· en· W1964830884 sur OpenAlexafffund
Nicolas Boutard, Stéphane Turcotte, Kim Beauregard, Christiane Quiniou, Sylvain Chemtob, William D. Lubell

Notice bibliographique

RevueJournal of Peptide Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité du Québec à MontréalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de Montréal
Mots-clésPeptideAllosteric regulationChemistryReceptorCircular dichroismProtein secondary structureStereochemistryAllosteric modulatorCyclic peptideAmino acidPeptide synthesisBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The relationship between the conformation and biological activity of the peptide allosteric modulator of the interleukin-1 receptor 101.10 (D-Arg-D-Tyr-D-Thr-D-Val-D-Glu-D-Leu-D-Ala-NH₂) has been studied using (R)- and (S)-Bgl residues. Twelve Bgl peptides were synthesized using (R)- and (S)-cyclic sulfamidate reagents derived from L- and D-aspartic acid in an optimized Fmoc-compatible protocol for efficient lactam installment onto the supported peptide resin. Examination of these (R)- and (S)-Bgl 101.10 analogs for their potential to inhibit IL-1β-induced thymocyte cell proliferation using a novel fluorescence assay revealed that certain analogs exhibited retained and improved potency relative to the parent peptide 101.10. In light of previous reports that Bgl residues may stabilize type II'β-turn-like conformations in peptides, CD spectroscopy was performed on selected compounds to identify secondary structure necessary for peptide biological activity. Results indicate that the presence of a fold about the central residues of the parent peptide may be important for activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,242

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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