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Enregistrement W1964909656 · doi:10.1371/journal.pone.0008420

Dissecting the Signaling Events That Impact Classical Nuclear Import and Target Nuclear Transport Factors

2009· article· en· W1964909656 sur OpenAlexafffund
Mohamed Kodiha, Dan Huy Tran, Andreea Morogan, Cynthia X. Qian, Ursula Stochaj

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésNucleoporinNuclear transportCell biologyNuclear poreImportinNuclear localization sequenceNuclear export signalKinaseCytoplasmSignal transductionSubcellular localizationBiologyPhosphorylationRetrograde signalingChemistryCell nucleus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Signaling through MEK-->ERK1/2 and PI3 kinases is implicated in many aspects of cell physiology, including the survival of oxidant exposure. Oxidants play a role in numerous physiological and pathophysiological processes, many of which rely on transport in and out of the nucleus. However, how oxidative stress impacts nuclear trafficking is not well defined. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: To better understand the effect of stress on nucleocytoplasmic trafficking, we exposed cells to the oxidant diethyl maleate. This treatment activated MEK-->ERK1/2 as well as PI3 kinase-->Akt cascades and triggered the inhibition of classical nuclear import. To define the molecular mechanisms that regulate nuclear transport, we examined whether MEK and PI3 kinase signaling affected the localization of key transport factors. Using recently developed tools for image acquisition and analysis, the subcellular distributions of importin-alpha, CAS, and nucleoporins Nup153 and Nup88 were quantified in different cellular compartments. These studies identified specific profiles for the localization of transport factors in the nucleus and cytoplasm, and at the nuclear envelope. Our results demonstrate that MEK and PI3 kinase signaling as well as oxidative stress control nuclear trafficking and the localization of transport components. Furthermore, stress not only induced changes in transport factor distribution, but also upregulated post-translational modification of transport factors. Our results are consistent with the idea that the phosphorylation of importin-alpha, CAS, Nup153, and Nup88, and the O-GlcNAc modification of Nup153 increase when cells are exposed to oxidant. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Our studies defined the complex regulation of classical nuclear import and identified key transport factors that are targeted by stress, MEK, and PI3 kinase signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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