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Enregistrement W1965046565 · doi:10.1584/jpestics.g06-08

Construction and validation of an insecticide resistance-associated DNA microarray

2007· article· en· W1965046565 sur OpenAlexfundno aff
Mao Ding, Qikang Gao, Jianchu Mo, Jiaan Cheng

Notice bibliographique

RevueJournal of Pesticide Science · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of Guelph
Mots-clésBiologyMicroarrayGeneMicroarray analysis techniquesDNA microarrayGeneticsGene expression profilingMolecular biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A microarray containing PCR products from a large number of candidate genes in insecticide resistance was constructed. A total of 646 genes putatively involved in insecticide resistance and positive control genes were obtained from six insect species, Apis cerana, Blattella germanica, Spodoptera exigua, Musca domestica, Nilaparrata lugens and Culex pipiens. These genes represent cytochrome P450, ion channel, protective enzyme and other genes, which may play important roles in insecticide resistance. The optical microarray printing concentration (250 ng/μl) was determined using gradient concentration hybridization assay. The DNA microarray was then constructed with all target genes. A PCR probe composed of 18 target genes was prepared to validate the hybridization specificity of the microarray. The positive rate of this validation test was 83.3%. In addition, analysis of differential gene expression between susceptible and multi-resistant (cypermethrin and malathion) strains of M. domestica showed that 17 genes were over-expressed in the resistant strain. The results imply that cytochrome P450 genes, especially the genes of CYP4 and 6 families, play important roles in the resistance of M. domestica to both insecticides. The 17 genes validated by using qRT-PCR were found to have a similar tendency, mostly compared with using a microarray, indicating that this microarray is suitable for studying insecticide resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,266

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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