Construction and validation of an insecticide resistance-associated DNA microarray
Notice bibliographique
Résumé
A microarray containing PCR products from a large number of candidate genes in insecticide resistance was constructed. A total of 646 genes putatively involved in insecticide resistance and positive control genes were obtained from six insect species, Apis cerana, Blattella germanica, Spodoptera exigua, Musca domestica, Nilaparrata lugens and Culex pipiens. These genes represent cytochrome P450, ion channel, protective enzyme and other genes, which may play important roles in insecticide resistance. The optical microarray printing concentration (250 ng/μl) was determined using gradient concentration hybridization assay. The DNA microarray was then constructed with all target genes. A PCR probe composed of 18 target genes was prepared to validate the hybridization specificity of the microarray. The positive rate of this validation test was 83.3%. In addition, analysis of differential gene expression between susceptible and multi-resistant (cypermethrin and malathion) strains of M. domestica showed that 17 genes were over-expressed in the resistant strain. The results imply that cytochrome P450 genes, especially the genes of CYP4 and 6 families, play important roles in the resistance of M. domestica to both insecticides. The 17 genes validated by using qRT-PCR were found to have a similar tendency, mostly compared with using a microarray, indicating that this microarray is suitable for studying insecticide resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».