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Enregistrement W1965064177 · doi:10.1074/jbc.m604958200

Contribution of Interferon-β to the Murine Macrophage Response to the Toll-like Receptor 4 Agonist, Lipopolysaccharide

2006· article· en· W1965064177 sur OpenAlexaff
Karen E. Thomas, Carole L. Galligan, Raj Deonarain Newman, Eleanor N. Fish, Stefanie N. Vogel

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensToronto General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésLipopolysaccharideToll-like receptorAgonistMacrophageInterferonReceptorChemistryImmunologyInnate immune systemMedicineIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interferon-beta (IFN-beta) has been identified as the signature cytokine induced via the Toll-like receptor (TLR) 4, "MyD88-independent" signaling pathway in macrophages stimulated by Gram-negative bacterial lipopolysaccharide (LPS). In this study, we analyzed the responses of macrophages derived from wild-type (IFN-beta(+/+)) mice or mice with a targeted mutation in IFN-beta (IFN-beta(-/-)) to the prototype TLR4 agonist, Escherichia coli LPS. A comparison of basal and LPS-induced gene expression (by reverse transcription-PCR, real-time PCR, and Affymetrix microarray analyses) resulted in the identification of four distinct patterns of gene expression affected by IFN-beta deficiency. Analysis of a subset of each group of differentially regulated genes by computer-assisted promoter analysis revealed putative IFN-responsive elements in all genes examined. LPS-induced activation of intracellular signaling molecules, STAT1 Tyr-701, STAT1 Ser-727, and Akt, but not p38, JNK, and ERK MAPK proteins, was significantly diminished in IFN-beta(-/-) versus IFN-beta(+/+) macrophages. "Priming" of IFN-beta(-/-) macrophages with exogenous recombinant IFN-beta significantly increased levels of LPS-induced gene expression for induction of monocyte chemotactic protein 5, inducible nitric-oxide synthase, IP-10, and IL-12 p40 mRNA, whereas no increase or relatively small increases were observed for IL-1beta, IL-6, monocyte chemotactic protein 1, and MyD88 mRNA. Finally, IFN-beta(-/-) mice challenged in vivo with LPS exhibited increased survival when compared with wild-type IFN-beta(+/+) controls, indicating that IFN-beta contributes to LPS-induced lethality; however, not to the extent that one observes in mice with more complete pathway deficiencies (e.g. TLR4(-/-) or TRIF(-/-) mice). Collectively, these findings reveal unanticipated regulatory roles for IFN-beta in response to LPS in vitro and in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,570

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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