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Enregistrement W1965105308 · doi:10.1046/j.1469-8137.2001.00076.x

Ancestry of <i>KNOX</i> genes revealed by bryophyte (<i>Physcomitrella patens</i>) homologs

2001· article· en· W1965105308 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhyscomitrella patensBiologyGeneBryophyteGeneticsPhylogenetic treeGene duplicationBryopsidaPlant evolutionHomology (biology)HomeoboxGene familyGenomeBotanyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Structural and phylogenetic studies of KNOX genes identified in the bryophyte Physcomitrella patens are reported here, to provide insights into the evolution of class 1 and class 2 KNOX genes. Three KNOTTED1 ‐like homeobox ( KNOX ) genomic clones were isolated and sequenced from P. patens . Corresponding cDNAs from a library, prepared from mRNA transcripts isolated from gametophytic tissues, were also sequenced. Conceptual translation and analysis of the bryophyte coding sequences revealed a domain pattern and secondary structures typical of higher plant KNOX proteins. Intron number and positions within the genes were also highly conserved between moss and angiosperm loci, providing further support for their homology. Structural and phylogenetic analyses indicated that moss clones ( MKN2 and MKN4 ) represent class 1 KNOX genes and the remaining clone ( MKN1–3 ) is a class 2 KNOX gene. We conclude that the observed protein domain pattern is encoded by homeobox genes that evolved after separation of the plant lineage from that of fungi and animals, and must have been present in the common ancestor to mosses and seed plants. It is proposed that gene duplication and diversification, which created class 1 and 2 KNOX gene subfamilies, occurred after separation of this common ancestor from its algal progenitor (since a characterized algal KNOX gene cannot be assigned to class 1 or 2), but before the moss and higher plant lineages diverged.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,376
Score d'incertitude au seuil0,409

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle