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Enregistrement W1965141776 · doi:10.3920/bm2012.0027

Transcriptomic response of immune signalling pathways in intestinal epithelial cells exposed to lipopolysaccharides, Gram-negative bacteria or potentially probiotic microbes

2012· article· en· W1965141776 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBeneficial Microbes · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensLallemand (Canada)Armand Frappier MuseumAgropur cooperative
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyImmune systemBacteriaMicrobiologyProbioticLipopolysaccharideMicrobiomeTranscriptomeMicroarrayGram-negative bacteriaGram-positive bacteriaPathogenic bacteriaImmunologyGene expressionEscherichia coliGeneBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to understand the appropriate use of potentially probiotic Gram-positive microbes through their introduction in the gut microbiome, it is necessary to understand the influence of individual bacteria on the host-response system at a cellular level. In the present study, we have shown that lipopolysaccharides, flagellated Gram-negative bacteria, potentially probiotic Gram-positive bacteria and yeast interact differently with human intestinal epithelial cells with a custom-designed expression microarray evaluating 17 specific host-response pathways. Only lipopolysaccharides and flagellated Gram-negative bacteria induced inflammatory response, while a subset of Gram-positive microbes had anti-inflammatory potential. The main outcome from the study was the differential regulation of the central mitogen-activated protein kinase signalling pathway by these Gram-positive microbes versus commensal/pathogenic Gram-negative bacteria. The microarray was efficient to highlight the impact of individual bacteria on the response of intestinal epithelial cells, but quantitative real-time polymerase chain reaction validation demonstrated some underestimation for down-regulated genes by the microarray. This immune array will allow us to better understand the mechanisms underlying microbe-induced host immune responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,650

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle