Elucidating the Formation of 6-Deoxyheptose: Biochemical Characterization of the GDP-<scp>d</scp>-<i>glycero</i>-<scp>d</scp>-<i>manno</i>-heptose C6 Dehydratase, DmhA, and Its Associated C4 Reductase, DmhB
Notice bibliographique
Résumé
6-Deoxyheptose is found within the surface polysaccharides of several bacterial pathogens. In Yersinia pseudotuberculosis, it is important for the barrier function of the O-antigen in vitro and for bacterial dissemination in vivo. The putative C6 dehydratase DmhA and C4 reductase DmhB, that were identified as responsible for 6-deoxyheptose synthesis based on genetics data, represent potential therapeutical targets. Their detailed biochemical characterization is presented herein. The substrate, GDP-D-glycero-D-manno-heptose, was synthesized enzymatically from sedoheptulose 7-phosphate using overexpressed and purified GmhA/B/C/D enzymes from Aneurinibacillus thermoaerophilus. Overexpressed and purified DmhA used this substrate with high efficiency, as indicated by its K(m) of 0.23 mM and k(cat) of 1.1 s(-1). The mass spectrometry (MS) analysis of the reaction product was consistent with a C6 dehydration reaction. DmhB could readily reduce this compound in the presence of NAD(P)H to produce GDP-6-deoxy-D-manno-heptose, as indicated by MS and NMR analyses. DmhA also used GDP-mannose as a substrate with a K(m) of 0.32 mM and a k(cat) of 0.25 min(-1). This kinetic analysis indicates that although the K(m) values for GDP-mannose and GDP-manno-heptose were similar, the genuine substrate for DmhA is GDP-manno-heptose. DmhB was also able to reduce the GDP-4-keto-6-deoxymannose produced by DmhA, although with poor efficiency and exclusively in the presence of NADPH. This study is the first complete biochemical characterization of the 6-deoxyheptose biosynthesis pathway. Also, it allows the screening for inhibitors, the elucidation of substrate specificity determinants, and the synthesis of carbohydrate antigens of therapeutic relevance.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
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