Three‐component‐mediated serotype conversion in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> by bacteriophage D3
Notice bibliographique
Résumé
Bacteriophage D3 is capable of lysogenizing Pseudomonas aeruginosa PAO1 (serotype O5), converting the O-antigen from O5 to O16 and O-acetylating the N-acetylfucosamine moiety. To investigate the mechanism of lysogenic conversion, a 3.6 kb fragment from the D3 genome was isolated capable of mediating serotypic conversion identical to the D3 lysogen strain (AK1380). The PAO1 transformants containing this 3.6 kb of D3 DNA exhibited identical lipopolysaccharide (LPS) banding patterns to serotype O16 in silver-stained SDS-PAGE gels and displayed reactivity to an antibody specific for O-acetyl groups. Further analysis led to the identification of three open reading frames (ORFs) required for serotype conversion: an alpha-polymerase inhibitor (iap); an O-acetylase (oac); and a beta-polymerase (wzybeta). The alpha-polymerase inhibitor (Iap) is capable of inhibiting the assembly of the serotype-specific O5 B-band LPS and allows the phage-encoded beta-polymerase (Wzybeta) to form new beta-linked B-band LPS. The D3 phage also alters the LPS by the addition of O-acetyl groups to the FucNAc residue in the O-antigen repeat unit by the action of the D3 O-acetylase (Oac). These three components form a simple yet elegant system by which bacteriophage D3 is capable of altering the surface of P. aeruginosa PAO1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».