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Detection of expansion regions in Portuguese bipolar families

2000· article· en· W1965379686 sur OpenAlexaff
Carlos N. Pato, António Macedo, Alda M. Ambrósio, John B. Vincent, Amy L. Bauer, Kim M. Schindler, Junzhe Xu, Isabel Coelho, Ana Dourado, José Armando Valente, M.H. Azevedo, James L. Kennedy, Michele T. Pato

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental Health
Mots-clésProbandAnticipation (artificial intelligence)Locus (genetics)GeneticsTrinucleotide repeat expansionPopulationCohortBiologyDiseaseDemographyInternal medicineMedicineAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have studied 24 families with multiple affected members with bipolar disorder to test the hypothesis that in those families clinically showing genetic anticipation [Macedo et al., 1999] we would find large repeat expansions. The families meeting inclusion criteria had a minimum of two affected members over two generations and showed marked anticipation both in terms of age of onset and disease severity. We used the repeat expansion detection (RED) method to test patients (n = 24) and controls from these families and unrelated controls (n = 53). We also genotyped patients and family members from two families with large expansions at the known expansion loci on chromosomes 13, 17, and 18. The RED method revealed a higher number of large expansions in patients compared with controls (t-test; P < 0.0055: Mann-Whitney U; P = 0.02). The patients with the largest expansions were typed at the specific loci on chromosomes 13, 17, and 18 and the chromosome 18 expansion locus segregated with disease in one family, and a second family showed segregation with the expansion located at the SCA8 locus on chromosome 13. Genetic anticipation had been analyzed in this cohort of families, with correction for potential ascertainment bias, possible proband effects, cohort effects, regression to the mean, gender effects, and maternal vs. paternal transmission. None of these potential confounds appeared to account for the observed anticipation. We also identified that the presence of large expansions in affected family members derives primarily from two families from the genetically isolated Azores population. One family shows segregation with the chromosome 18 locus, whereas the other family segregates with expansions at the SCA8 locus. Am. J. Med. Genet. (Neuropsychiatr. Genet.) 96:854-857, 2000.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,963
Score d'incertitude au seuil0,274

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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