Colonization of Returning Travelers With CTX‐M‐Producing<i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: We previously identified foreign travel as a risk factor for acquiring infections due to CTX-M (active on cefotaxime first isolated in Munich) producing Escherichia coli. The objective of this study was to assess the prevalence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing E coli among stool samples submitted from travelers as compared to non-travelers (a non-traveler had not been outside of Canada for at least 6 months before submitting a stool specimen). METHODS: Once a travel case was identified, the next stool from a non-traveler (not been outside of Canada for at least 6 months) was included and cultured on the chromID-ESBL selection media. Molecular characterization was done using polymerase chain reaction and sequencing for bla(CTX-Ms), bla(TEMs), bla(SHVs), plasmid-mediated quinolone-resistant determinants, O25-ST131, phylogenetic groups, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), and multilocus sequencing typing. RESULTS: A total of 226 individuals were included; 195 (86%) were negative, and 31 (14%) were positive for ESBL-producing E coli. Notably, travelers were 5.2 (95% CI 2.1-31.1) times more likely than non-travelers to have an ESBL-producing E coli cultured from their stool. The highest rates of ESBL positivity were associated with travel to Africa or the Indian subcontinent. Among the 31 ESBL-producing E coli isolated, 22 produced CTX-M-15, 8 produced CTX-M-14, 1 produced CTX-M-8, 12 were positive for aac(6')-Ib-cr, and 8 belonged to clone ST131. CONCLUSIONS: Our study confirms that foreign travel, especially to the Indian subcontinent and Africa, represents a major risk for rectal colonization with CTX-M-producing E coli and contributed to the Worldwide spread of these bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».