Variations in DNA Methylation Patterns During the Cell Cycle of HeLa Cells
Notice bibliographique
Résumé
DNA methylation has been viewed as a stable component of the epigenome, which is established during development and fixed thereafter. We show here using nearest neighbor analysis, immunocytochemistry, and high performance capillary electrophoresis that the DNA methylation pattern varies in HeLa cells during a single cell cycle. Immunocytochemical analysis in primary human fibroblasts shows similar variations. The global levels of DNA methylation decreased in G1 and increase during the S phase of the cell cycle. Since there was little change in the DNA methylation levels in repetitive sequences throughout the cell cycle, we examined the DNA methylation pattern of unique sequences using a human CpG island microarray. Hybridization with methylated DNA from G1 and S phase of the cell cycle revealed that 174 CG-containing sequences were differentially methylated between G1 and S. 75% of all the variations in DNA methylation detected in unique sequences represented hypomethylation at G0, with changes occurring in both CpG islands and non-CpG islands. Bisulfite mapping confirmed these changes in methylation in the regions identified by the microarray. This is the first demonstration of a dynamic DNA methylation pattern within a single cell cycle of a mature somatic cell. These data are important for our understanding of the stability of DNA methylation patterns in somatic cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».