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Enregistrement W1966851354 · doi:10.1021/bi802004j

Effect of Removing the Amino-Terminal Hexapeptide of Tropomyosin on the Properties of the Thin Filament

2009· article· en· W1966851354 sur OpenAlexaff
Charitha L. Goonasekara, David H. Heeley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTropomyosinActinChemistryEGTATroponin TMyosinTroponinBiochemistryAutolysis (biology)Troponin CBiophysicsCalciumBiologyEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of the amino-terminal region of alpha-striated muscle tropomyosin has been analyzed by reconstituting thin filaments with a version of the protein lacking the first six amino acids. While Omp T-digested tropomyosin (residues 7-284) does not bind significantly to F-actin at micromolar concentrations, an interaction is induced by skeletal troponin. At a moderate ionic strength (50 mM KCl), the apparent Kd values are 0.26 microM (with EGTA) and 1.6 microM (with Ca2+). At higher neutral salt (140 mM KCl), reconstitution is observed in the micromolar range only at high pCa (Kd = 1.3 microM). However, when chloride is replaced by acetate, the binding isotherms reach saturation under both extremes of Ca2+ [apparent Kd values of 0.32 microM (with EGTA) and 2.6 microM (with Ca2+)]. The induction of binding of truncated tropomyosin to F-actin by troponin is attributable, in part, to troponin-I, but whereas the amino-terminal fragment of troponin-T (N-Tn-T, residues 1-158) enhances the effect of troponin-I in the case of other tropomyosin products specifically, unacetylated tropomyosin (residues 1-284), and carboxypeptidase-digested tropomyosin (residues 1-273) [Heeley, D. H., et al. (1987) J. Biol. Chem. 262, 9971-9978], it is ineffective with regard to Omp T-digested tropomyosin, suggesting that cleavage has disrupted a binding site for this section of troponin-T. Thin filaments (with Ca2+) containing Omp T-digested tropomyosin activate the steady-state myosin-MgATPase to a greater extent than the integral system, consistent with the interaction between N-Tn-T and the amino-terminal region of tropomyosin having a regulatory function. At high pCa, the truncated system exhibits a less cooperative interaction with myosin-S1-ADP but the affinity for the ligand is stronger. In context with the current methodologies, the consequences of shortening tropomyosin at one end as opposed to the other are the reverse of each other.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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