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Enregistrement W1967360045 · doi:10.1002/humu.10203

Characterization of 17 novel endoglin mutations associated with hereditary hemorrhagic telangiectasia

2003· article· en· W1967360045 sur OpenAlexaff
Urszula Cymerman, Sonia Vera, Amna Karabegovic, S A Abdalla, Michelle Letarte

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVascular Anomalies and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonBiologyGeneticsMolecular biologySplice site mutationMissense mutationTelangiectasesMultiplex ligation-dependent probe amplificationMutationFrameshift mutationNonsense mutationExon skippingspliceMutantExon trappingGeneAlternative splicingTelangiectasiaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hereditary hemorrhagic telangiectasia type 1 (HHT1) is a vascular dysplasia caused by mutations in the endoglin (ENG) gene and associated with epistaxis, telangiectases, and a high incidence of pulmonary arteriovenous malformations. To efficiently detect deletions and insertions, we optimized a quantitative multiplex polymerase chain reaction (QMPCR) analysis. We report 17 novel mutations, of which six were detected by QMPCR. Three deletions occurring in intronic sequences were associated with a single copy of exons 9a-14, exon 5, and exons 7-8, respectively. A transient 70kDa monomeric mutant protein resulted from the in-frame deletion of exons 7 and 8 but no mutant protein was present in the other cases. Deletion (in exon 10) or insertion (in exon 7) of two nucleotides, as well as a 1-bp deletion in the small exon 9a were found by QMPCR. Sequencing was required to detect single nucleotide deletions/insertions in exons 2, 5, 6, and 8. No mutant proteins were associated with these frame shift mutations. Two novel splice site mutations resulted in skipping of exons 2 and 4, respectively, while a previously reported intron 3 splice mutant was observed as a de novo mutation. We also report five novel nonsense and missense mutations, including one de novo. Review of the 80 HHT1 families reported to date indicates that 10% would not be resolved by sequencing and that an additional 25% could be revealed by QMPCR performed prior to sequencing. Thus the use of QMPCR accelerates genetic screening for HHT1 and resolves mutations affecting whole exons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,761
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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