Characterization of 17 novel endoglin mutations associated with hereditary hemorrhagic telangiectasia
Notice bibliographique
Résumé
Hereditary hemorrhagic telangiectasia type 1 (HHT1) is a vascular dysplasia caused by mutations in the endoglin (ENG) gene and associated with epistaxis, telangiectases, and a high incidence of pulmonary arteriovenous malformations. To efficiently detect deletions and insertions, we optimized a quantitative multiplex polymerase chain reaction (QMPCR) analysis. We report 17 novel mutations, of which six were detected by QMPCR. Three deletions occurring in intronic sequences were associated with a single copy of exons 9a-14, exon 5, and exons 7-8, respectively. A transient 70kDa monomeric mutant protein resulted from the in-frame deletion of exons 7 and 8 but no mutant protein was present in the other cases. Deletion (in exon 10) or insertion (in exon 7) of two nucleotides, as well as a 1-bp deletion in the small exon 9a were found by QMPCR. Sequencing was required to detect single nucleotide deletions/insertions in exons 2, 5, 6, and 8. No mutant proteins were associated with these frame shift mutations. Two novel splice site mutations resulted in skipping of exons 2 and 4, respectively, while a previously reported intron 3 splice mutant was observed as a de novo mutation. We also report five novel nonsense and missense mutations, including one de novo. Review of the 80 HHT1 families reported to date indicates that 10% would not be resolved by sequencing and that an additional 25% could be revealed by QMPCR performed prior to sequencing. Thus the use of QMPCR accelerates genetic screening for HHT1 and resolves mutations affecting whole exons.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».