Molecular systematics of some North American species of <i>Diplostomum</i> (Digenea) based on rDNA-sequence data and comparisons with European congeners
Notice bibliographique
Résumé
The systematics of Diplostomum species, common intestinal parasites of piscivorous birds, has long been problematic, owing to phenotypic plasticity and the paucity of morphological features that are often subject to age- and host-induced variation. We sequenced the ITS15.8SITS2 regions of the rDNA from adult Diplostomum huronense, Diplostomum indistinctum, and Diplostomum baeri obtained from experimentally infected ring-bill gulls (Larus delawarensis) and compared them with partial ITS1 sequences from several species of Diplostomum in GenBank. The three North American species were distinguishable on the basis of ITS sequences. Sequences from D. huronense differed from those of D. indistinctum at 12 sites in ITS1 and 4 sites in ITS2, supporting morphological and morphometric data that indicate the two are distinct species. Sequences of D. huronense and D. indistinctum differed from those of D. baeri at 27 and 24 sites, respectively, in ITS1 and 15 and 12 sites, respectively, in ITS2. Phylogenetic analysis of partial ITS1 sequences revealed that the North American and European species of Diplostomum formed separate groups, with the former being basal to the latter. The results indicated that D. huronense and D. indistinctum from North America are distinct from Diplostomum spathaceum and other similar species from Europe. Furthermore, sequences from specimens identified as D. baeri from North America differed from those of D. baeri from Europe by 3.8% in ITS1 (23 sites). While morphologically similar, the two are not conspecific. Sequences of the North American species have been deposited in GenBank (AY 123042123044).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».